Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SrfQ9JM73 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrfQ9JM73 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms