Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsmQ9JL96 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsmQ9JL96 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms