Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stx6Q9JKK1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stx6Q9JKK1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms