Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssna1Q9JJ94 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ssna1Q9JJ94 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssna1Q9JJ94 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssna1Q9JJ94 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssna1Q9JJ94 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssna1Q9JJ94 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ssna1Q9JJ94 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ssna1Q9JJ94 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssna1Q9JJ94 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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