Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2ird1Q9JI57 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms