Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr61Q9ERF3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Wdr61Q9ERF3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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