Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aph1cQ9DCZ9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Aph1cQ9DCZ9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms