Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl4Q9DCU6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms