Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnft1Q9DCN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms