Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx5Q9D8U8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx5Q9D8U8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms