Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lin37Q9D8N6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Lin37Q9D8N6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lin37Q9D8N6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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