Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sh2d4aQ9D7V1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms