Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D7E4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D7E4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D7E4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D7E4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D7E4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D7E4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D7E4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms