Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc83Q9D4V3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms