Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930556J24RikQ9D4U7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms