Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Odf2lQ9D478 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Odf2lQ9D478 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms