Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rnf128Q9D304 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf128Q9D304 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Rnf128Q9D304 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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