Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc6bQ9D289 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms