Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc47Q9D024 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc47Q9D024 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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