Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prelid3bQ9CYY7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms