Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PmpcbQ9CXT8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms