Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed5Q9CXE7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms