Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Xrcc3Q9CXE6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc3Q9CXE6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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