Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf1Q9CWX2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ndufaf1Q9CWX2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms