Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfdn1Q9CWM4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pfdn1Q9CWM4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfdn1Q9CWM4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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