Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MINDY3Q9CV28 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MINDY3Q9CV28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms