Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q9CRW3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms