Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Txndc17Q9CQM5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Txndc17Q9CQM5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Txndc17Q9CQM5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Txndc17Q9CQM5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Txndc17Q9CQM5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms