Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nipsnap3bQ9CQE1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms