Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms