Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Commd4Q9CQ02 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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