Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Krt88Q9CPR6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Krt88Q9CPR6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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