Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep41Q99NF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms