Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rcbtb2Q99LJ7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rcbtb2Q99LJ7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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