Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlgn1Q99K10 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlgn1Q99K10 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms