Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spef1Q99JL1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms