Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q91WD4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q91WD4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q91WD4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q91WD4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q91WD4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q91WD4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q91WD4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q91WD4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms