Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Slc6a20aQ8VDB9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc6a20aQ8VDB9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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