Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC56

Rnf8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf8Q8VC56 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf8Q8VC56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf8Q8VC56 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf8Q8VC56 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf8Q8VC56 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms