Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc12Q8R344 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms