Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxc12Q8K5B8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hoxc12Q8K5B8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hoxc12Q8K5B8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hoxc12Q8K5B8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hoxc12Q8K5B8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hoxc12Q8K5B8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hoxc12Q8K5B8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hoxc12Q8K5B8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc12Q8K5B8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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