Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud6bQ8K2H2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms