Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stx5Q8K1E0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms