Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx6Q8C7R7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx6Q8C7R7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx6Q8C7R7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rfx6Q8C7R7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rfx6Q8C7R7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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