Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg16l1Q8C0J2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms