Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc50Q810U5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms