Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Npm2Q80W85 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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Npm2Q80W85 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Npm2Q80W85 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms