Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp3Q7TST5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms