Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp397Q7TNK4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms