Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf653Q6YND2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Znf653Q6YND2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms